En la antigüedad, los japoneses creían que todos los fenómenos naturales, animales y plantas poseían kami, o poder divino. Esta creencia llegó a ser conocida como sintoísmo y se estableció como una religión oficial después de que el budismo y el confucianismo fueran introducidos en Japón. El budismo llegó a Japón desde Asia continental en el siglo VI. Sus enseñanzas fueron adoptadas por los gobernantes de la época y luego se extendió al público en general durante el período Heian (794-1192) y el período Kamakura (1192-1338).
El sintoísmo y el budismo se han convertido en partes importantes de la vida japonesa diaria. En la víspera de año nuevo, por ejemplo, el sonido de las campanas de los templos budistas llenan el aire. Y en el día de año nuevo, la gente visita los santuarios sintoístas y los templos budistas para orar por la buena fortuna en el próximo año. Durante los equinoccios de primavera y otoño y también en el festival de Obon (en julio y agosto), las familias realizan servicios conmemorativos budistas para sus antepasados. También a lo largo del año, los pueblos y aldeas celebran festivales sintoístas, donde los participantes transportan santuarios portátiles sobre sus hombros y remolcan carrozas por las calles. Las ceremonias de boda son generalmente sintoístas, mientras que los entierros tienden a ser budistas. Además, muchas familias tienen santuarios sintoístas de pequeños tamaños y altares budistas en sus hogares.
El cristianismo también ha echado raíces en Japón; Un misionero jesuita de España, Francisco de Xavier, introdujo la religión a Japón en el siglo XVI. Los gobernantes feudales del país prohibieron el cristianismo durante el período Edo (1603-1868), pero hizo un regreso durante la era Meiji (1868-1912). Hoy en día, el sintoísmo tiene el mayor número de creyentes, seguido por el budismo y el cristianismo.